Methods in biotechnologyLaajuus (5 op)
Tunnus: 5021167
Laajuus
5 op
Osaamistavoitteet
Opintojakson jälkeen opiskelija osaa
- valmistaa kudosteknologiassa käytettäviä biomateriaaleja
- valmistaa diagnostiikassa käytettäviä tai muita teollisesti tärkeitä molekyylejä bioprosessilla
- käyttää tärkeimpiä analyysimenetelmiä, joita käytetään biomateriaalien karakterisoinnissa, geenitekniikassa, diagnostiikassa ja bioprosesseissa
Sisältö
- analyyttiset menetelmien ja valmistusmenetelmien laboratoriotyöt (biomateriaalit, kudosteknologia geenitekniikka, diagnostiikka ja bioprosessit)
Ilmoittautumisaika
01.06.2024 - 11.11.2024
Ajoitus
11.11.2024 - 13.12.2024
Opintopistemäärä
5 op
Toteutustapa
Lähiopetus
Yksikkö
Kemiantekniikka
Toimipiste
Lemminkäisenkatu
Opetuskielet
- Suomi
Paikat
0 - 20
Koulutus
- Bio- ja kemiantekniikan koulutus
Opettaja
- Jani Pelkonen
Ryhmät
-
PBIOKES21Bio- ja kemiantekniikan koulutus
-
PBIOKES21BioPBIOKES21Bio
Tavoitteet
Opintojakson jälkeen opiskelija osaa
- valmistaa kudosteknologiassa käytettäviä biomateriaaleja
- valmistaa diagnostiikassa käytettäviä tai muita teollisesti tärkeitä molekyylejä bioprosessilla
- käyttää tärkeimpiä analyysimenetelmiä, joita käytetään biomateriaalien karakterisoinnissa, geenitekniikassa, diagnostiikassa ja bioprosesseissa
Sisältö
- analyyttiset menetelmien ja valmistusmenetelmien laboratoriotyöt (biomateriaalit, kudosteknologia geenitekniikka, diagnostiikka ja bioprosessit)
Oppimateriaalit
Most of the material will be available on Its-learning environment. Some material student need to find itself according to instructions on Its
Opetusmenetelmät
Laboratory work in groups, team-based learning in groups
Tenttien ajankohdat ja uusintamahdollisuudet
No exam, assessment is based on reporting, study plans, overall performance in laboratory and laboratory notebook.
Pedagogiset toimintatavat ja kestävä kehitys
Hands on practical training.
Sustainable development aspect is taken into consideration for example in laboratory work scaling, reagent consumption and waste management.
Toteutuksen valinnaiset suoritustavat
2-4 students may conduct the course by working in the the research group (Biomaterials and Diagnostics). This type of the implementation has to be agreed separate with the instructors (Jani Pelkonen and Kari Haajanen).
Opiskelijan ajankäyttö ja kuormitus
Approximation:
Preparing and self study for labworks: 28 h
* pretasks for labworks and self study
Laboratory works: 72 h
* three topics, one topic per week and three lab days (8 h) per week (-> 72 h)
Reporting: 30
* Compiling the laboratory report
Sisällön jaksotus
Methods in Biotechnology will be implemented as a conventional lab implementation consisting of three larger work topics.
PRELIMINARY CONTENT:
1) Bioreactor cultivation of E. coli and production of mEGFP protein.
2) Downstream and purification (heat treatment + affinity chromatography) of mEGFP including gel and total protein analysis.
3) Production of hydrogel ceramic composite, 3D printed implant, crosslinking with different times and rheological analyses of material properties.
The reporting consists of one video report and one conventional laboratory report both made by group. Deadline for video reporting is two weeks from the end of downstream labwork. Hydrogel 3D printing and rheology labwork report (conventional) deadline is 15.1.2025.
Arviointiasteikko
H-5
Arviointimenetelmät ja arvioinnin perusteet
Video and written report assessed on scale 0 – 5 (group evaluation).
Overall performance in laboratory during the 3 working weeks and Laboratory notebook (incl. written study & analysis plans i.e. weekly schedules incl. daily tasks) can affect +/- 1 grade individually.
Hylätty (0)
There are clear deficiencies in the work plans, or they have not been made, and the planned schedule is not being followed.
Laboratory work cannot be performed without guidance.
Essential entries are missing from the laboratory notebook.
Laboratory reports have significant deficiencies or have not been completed.
Arviointikriteerit, tyydyttävä (1-2)
There are deficiencies in the work plans and/or it is difficult to adhere to the planned schedule.
Continuous guidance is needed in laboratory work.
There are deficiencies in the entries of the laboratory notebook.
There are deficiencies in the laboratory reports.
Arviointikriteerit, hyvä (3-4)
There are minor deficiencies in the work plans, and there are occasional challenges in adhering to the planned schedule.
Minimal guidance is needed in laboratory work.
There are minor deficiencies in the entries of the laboratory notebook, but observations and conclusions are presented.
The laboratory reports meet the assignment requirements, but there are some or minor deficiencies.
Arviointikriteerit, kiitettävä (5)
The work plans are comprehensive, and the planned schedule is adhered to.
Laboratory work is independent and competent.
The entries in the laboratory notebook are comprehensive, and the observations and conclusions are well-founded.
The laboratory reports meet the assignment requirements, and they are clear and comprehensive. The discussion of the results and the conclusions presented in the reports are well-founded.
Ilmoittautumisaika
01.06.2023 - 13.11.2023
Ajoitus
13.11.2023 - 31.12.2023
Opintopistemäärä
5 op
Toteutustapa
Lähiopetus
Yksikkö
Tekniikka ja liiketoiminta
Opetuskielet
- Suomi
- Englanti
Koulutus
- Bio- ja kemiantekniikan koulutus
Opettaja
- Jani Pelkonen
Ryhmät
-
PBIOKES20Bio- ja kemiantekniikan koulutus
-
PBIOKES20bioPBIOKES20bio
Tavoitteet
Opintojakson jälkeen opiskelija osaa
- valmistaa kudosteknologiassa käytettäviä biomateriaaleja
- valmistaa diagnostiikassa käytettäviä tai muita teollisesti tärkeitä molekyylejä bioprosessilla
- käyttää tärkeimpiä analyysimenetelmiä, joita käytetään biomateriaalien karakterisoinnissa, geenitekniikassa, diagnostiikassa ja bioprosesseissa
Sisältö
- analyyttiset menetelmien ja valmistusmenetelmien laboratoriotyöt (biomateriaalit, kudosteknologia geenitekniikka, diagnostiikka ja bioprosessit)
Oppimateriaalit
Most of the material will be available on Its-learning environment. Some material student need to find itself according to instructions on Its
Opetusmenetelmät
Laboratory work in groups, team-based learning in groups
Tenttien ajankohdat ja uusintamahdollisuudet
No exam, assessment is based on study plans, overall performance in laboratory, laboratory notebook and writen report.
Toteutuksen valinnaiset suoritustavat
2-4 students may conduct the course by working in the the research group (Biomaterials and Diagnostics). This type of the implementation has to be agreed separate with the instructors (Mika Jokinen and Jani Pelkonen).
Sisällön jaksotus
Methods in Biotechnology will be implemented as a conventional lab implementation concsisting of three larger work topics:
1) Bioreactor cultivation of E. coli and production of mEGFP protein.
2) Downstream and purification (heat treatment + affinity chromatography) of mEGFP including gel and total protein analysis.
3) Production of alginate based ceramic hydrogel, 3D printed implant, crossling with different times and rheological analyses of material properties.
The reporting consists of one group report coverin all 3 topics. The deadline for the final report is XX th of January 2024.
Arviointiasteikko
H-5
Arviointimenetelmät ja arvioinnin perusteet
Written report 0 – 5 (group evaluation)
Overall performance in laboratory during the 3 working weeks and Laboratory notebook (incl. written study & analysis plans i.e. weekly schedules incl. daily tasks) can affact +/- 1 grade individually.
Hylätty (0)
Työsuunnitelmissa on selviä puutteita tai ne on tekemättä ja suunnitellussa aikataulussa ei pysytä.
Laboratoriotyöskentely ei onnistu ilman ohjausta.
Laboratoripäiväkirjasta puuttuvat oleelliset kirjaukset.
Laboratorioraporteissa on oleellisia puutteita tai ne on tekemättä.
Arviointikriteerit, tyydyttävä (1-2)
Työsuunnitelmissa on puutteita tai ja suunnitellussa aikataulussa on vaikea pysytä
Laboratoriotyöskentelyssä tairvitaan jatkuvaa ohjausta.
Laboratoripäiväkirjan kirjauksissa on puutteita.
Laboratorioraportieissa on puutteita.
Arviointikriteerit, hyvä (3-4)
Työsuunnitelmissa on vähäisiä puutteita ja suunnitellussa aikataulussa on ajoittaisia haasteita.
Laboratoriotyöskentelyssä tairvitaan vähäistä ohjausta.
Laboratoripäiväkirjan kirjauksissa on vähäisiä puutteita, mutta havaintoja ja johtopäätöksiä on esitetty.
Laboratorioraportit vastaavat tehtävienantoja, mutta niissä on vähäisiä puutteita.
Arviointikriteerit, kiitettävä (5)
Työsuunnitelmat ovat kattavia ja suunnitellussa aikataulussa pysytään.
Laboratoriotyöskentely on itsenäistä ja osaavaa.
Laboratoripäiväkirjan kirjaukset ovat kattavia ja havainnot sekä johtopäätökset ovat perusteltuja.
Laboratorioraportit vastaavat tehtävienantoja ja ne ovat selkeitä sekä kattavia. Raporteissa esitetyttyjen tulosten pohdinta ja johtopäätökset ovat perusteltuja.
Ilmoittautumisaika
01.06.2022 - 18.09.2022
Ajoitus
14.11.2022 - 16.12.2022
Opintopistemäärä
5 op
Toteutustapa
Lähiopetus
Yksikkö
Tekniikka ja liiketoiminta
Toimipiste
Kupittaan kampus
Opetuskielet
- Suomi
- Englanti
Koulutus
- Prosessi- ja materiaalitekniikan koulutus
Opettaja
- Jani Pelkonen
Ryhmät
-
PBIOKES19Bio- ja kemiantekniikan koulutus koulutus
-
PBIOKES19bioPBIOKES19bio
Tavoitteet
Opintojakson jälkeen opiskelija osaa
- valmistaa kudosteknologiassa käytettäviä biomateriaaleja
- valmistaa diagnostiikassa käytettäviä tai muita teollisesti tärkeitä molekyylejä bioprosessilla
- käyttää tärkeimpiä analyysimenetelmiä, joita käytetään biomateriaalien karakterisoinnissa, geenitekniikassa, diagnostiikassa ja bioprosesseissa
Sisältö
- analyyttiset menetelmien ja valmistusmenetelmien laboratoriotyöt (biomateriaalit, kudosteknologia geenitekniikka, diagnostiikka ja bioprosessit)
Oppimateriaalit
Most of the material will be available on Its-learning environment. Some material student need to find itself according to instructions on Its
Opetusmenetelmät
Laboratory work in groups, team-based learning in groups
Tenttien ajankohdat ja uusintamahdollisuudet
No exam, assessment is based on study plans, overall performance in laboratory, laboratory notebook and writen report.
Toteutuksen valinnaiset suoritustavat
2-4 students may conduct the course by working in the the research group (Biomaterials and Diagnostics). This type of the implementation has to be agreed separate with the instructors (Mika Jokinen and Jani Pelkonen).
Sisällön jaksotus
Methods in Biotechnology will be implemented as a conventional lab implementation concsisting of three larger work topics:
1) Bioreactor cultivation of E. coli and production of mEGFP protein.
2) Downstream and purification (heat treatment + affinity chromatography) of mEGFP including gel and total protein analysis.
3) Production of alginate based ceramic hydrogel, 3D printed implant, crossling with different times and rheological analyses of material properties.
The reporting consists of one group report coverin all 3 topics. The deadline for the final report is 15 th of January 2023.
Arviointiasteikko
H-5
Arviointimenetelmät ja arvioinnin perusteet
Written report 0 – 5 (group evaluation)
Overall performance in laboratory during the 3 working weeks and Laboratory notebook (incl. written study & analysis plans i.e. weekly schedules incl. daily tasks) can affact +/- 1 grade individually.
Hylätty (0)
Työsuunnitelmissa on selviä puutteita tai ne on tekemättä ja suunnitellussa aikataulussa ei pysytä.
Laboratoriotyöskentely ei onnistu ilman ohjausta.
Laboratoripäiväkirjasta puuttuvat oleelliset kirjaukset.
Laboratorioraporteissa on oleellisia puutteita tai ne on tekemättä.
Arviointikriteerit, tyydyttävä (1-2)
Työsuunnitelmissa on puutteita tai ja suunnitellussa aikataulussa on vaikea pysytä
Laboratoriotyöskentelyssä tairvitaan jatkuvaa ohjausta.
Laboratoripäiväkirjan kirjauksissa on puutteita.
Laboratorioraportieissa on puutteita.
Arviointikriteerit, hyvä (3-4)
Työsuunnitelmissa on vähäisiä puutteita ja suunnitellussa aikataulussa on ajoittaisia haasteita.
Laboratoriotyöskentelyssä tairvitaan vähäistä ohjausta.
Laboratoripäiväkirjan kirjauksissa on vähäisiä puutteita, mutta havaintoja ja johtopäätöksiä on esitetty.
Laboratorioraportit vastaavat tehtävienantoja, mutta niissä on vähäisiä puutteita.
Arviointikriteerit, kiitettävä (5)
Työsuunnitelmat ovat kattavia ja suunnitellussa aikataulussa pysytään.
Laboratoriotyöskentely on itsenäistä ja osaavaa.
Laboratoripäiväkirjan kirjaukset ovat kattavia ja havainnot sekä johtopäätökset ovat perusteltuja.
Laboratorioraportit vastaavat tehtävienantoja ja ne ovat selkeitä sekä kattavia. Raporteissa esitetyttyjen tulosten pohdinta ja johtopäätökset ovat perusteltuja.