Siirry suoraan sisältöön

Methods in biotechnologyLaajuus (5 op)

Tunnus: 5021167

Laajuus

5 op

Osaamistavoitteet

Opintojakson jälkeen opiskelija osaa
- valmistaa kudosteknologiassa käytettäviä biomateriaaleja

- valmistaa diagnostiikassa käytettäviä tai muita teollisesti tärkeitä molekyylejä bioprosessilla

- käyttää tärkeimpiä analyysimenetelmiä, joita käytetään biomateriaalien karakterisoinnissa, geenitekniikassa, diagnostiikassa ja bioprosesseissa

Sisältö

- analyyttiset menetelmien ja valmistusmenetelmien laboratoriotyöt (biomateriaalit, kudosteknologia geenitekniikka, diagnostiikka ja bioprosessit)

Ilmoittautumisaika

01.06.2024 - 11.11.2024

Ajoitus

11.11.2024 - 13.12.2024

Opintopistemäärä

5 op

Toteutustapa

Lähiopetus

Yksikkö

Kemiantekniikka

Toimipiste

Lemminkäisenkatu

Opetuskielet
  • Suomi
Paikat

0 - 20

Koulutus
  • Bio- ja kemiantekniikan koulutus
Opettaja
  • Jani Pelkonen
Ryhmät
  • PBIOKES21
    Bio- ja kemiantekniikan koulutus
  • PBIOKES21Bio
    PBIOKES21Bio

Tavoitteet

Opintojakson jälkeen opiskelija osaa
- valmistaa kudosteknologiassa käytettäviä biomateriaaleja

- valmistaa diagnostiikassa käytettäviä tai muita teollisesti tärkeitä molekyylejä bioprosessilla

- käyttää tärkeimpiä analyysimenetelmiä, joita käytetään biomateriaalien karakterisoinnissa, geenitekniikassa, diagnostiikassa ja bioprosesseissa

Sisältö

- analyyttiset menetelmien ja valmistusmenetelmien laboratoriotyöt (biomateriaalit, kudosteknologia geenitekniikka, diagnostiikka ja bioprosessit)

Oppimateriaalit

Most of the material will be available on Its-learning environment. Some material student need to find itself according to instructions on Its

Opetusmenetelmät

Laboratory work in groups, team-based learning in groups

Tenttien ajankohdat ja uusintamahdollisuudet

No exam, assessment is based on reporting, study plans, overall performance in laboratory and laboratory notebook.

Pedagogiset toimintatavat ja kestävä kehitys

Hands on practical training.
Sustainable development aspect is taken into consideration for example in laboratory work scaling, reagent consumption and waste management.

Toteutuksen valinnaiset suoritustavat

2-4 students may conduct the course by working in the the research group (Biomaterials and Diagnostics). This type of the implementation has to be agreed separate with the instructors (Jani Pelkonen and Kari Haajanen).

Opiskelijan ajankäyttö ja kuormitus

Approximation:
Preparing and self study for labworks: 28 h
* pretasks for labworks and self study
Laboratory works: 72 h
* three topics, one topic per week and three lab days (8 h) per week (-> 72 h)
Reporting: 30
* Compiling the laboratory report

Sisällön jaksotus

Methods in Biotechnology will be implemented as a conventional lab implementation consisting of three larger work topics.

PRELIMINARY CONTENT:
1) Bioreactor cultivation of E. coli and production of mEGFP protein.
2) Downstream and purification (heat treatment + affinity chromatography) of mEGFP including gel and total protein analysis.
3) Production of hydrogel ceramic composite, 3D printed implant, crosslinking with different times and rheological analyses of material properties.

The reporting consists of one video report and one conventional laboratory report both made by group. Deadline for video reporting is two weeks from the end of downstream labwork. Hydrogel 3D printing and rheology labwork report (conventional) deadline is 15.1.2025.

Arviointiasteikko

H-5

Arviointimenetelmät ja arvioinnin perusteet

Video and written report assessed on scale 0 – 5 (group evaluation).
Overall performance in laboratory during the 3 working weeks and Laboratory notebook (incl. written study & analysis plans i.e. weekly schedules incl. daily tasks) can affect +/- 1 grade individually.

Hylätty (0)

There are clear deficiencies in the work plans, or they have not been made, and the planned schedule is not being followed.
Laboratory work cannot be performed without guidance.
Essential entries are missing from the laboratory notebook.
Laboratory reports have significant deficiencies or have not been completed.

Arviointikriteerit, tyydyttävä (1-2)

There are deficiencies in the work plans and/or it is difficult to adhere to the planned schedule.
Continuous guidance is needed in laboratory work.
There are deficiencies in the entries of the laboratory notebook.
There are deficiencies in the laboratory reports.

Arviointikriteerit, hyvä (3-4)

There are minor deficiencies in the work plans, and there are occasional challenges in adhering to the planned schedule.
Minimal guidance is needed in laboratory work.
There are minor deficiencies in the entries of the laboratory notebook, but observations and conclusions are presented.
The laboratory reports meet the assignment requirements, but there are some or minor deficiencies.

Arviointikriteerit, kiitettävä (5)

The work plans are comprehensive, and the planned schedule is adhered to.
Laboratory work is independent and competent.
The entries in the laboratory notebook are comprehensive, and the observations and conclusions are well-founded.
The laboratory reports meet the assignment requirements, and they are clear and comprehensive. The discussion of the results and the conclusions presented in the reports are well-founded.

Ilmoittautumisaika

01.06.2023 - 13.11.2023

Ajoitus

13.11.2023 - 31.12.2023

Opintopistemäärä

5 op

Toteutustapa

Lähiopetus

Yksikkö

Tekniikka ja liiketoiminta

Opetuskielet
  • Suomi
  • Englanti
Koulutus
  • Bio- ja kemiantekniikan koulutus
Opettaja
  • Jani Pelkonen
Ryhmät
  • PBIOKES20
    Bio- ja kemiantekniikan koulutus
  • PBIOKES20bio
    PBIOKES20bio

Tavoitteet

Opintojakson jälkeen opiskelija osaa
- valmistaa kudosteknologiassa käytettäviä biomateriaaleja

- valmistaa diagnostiikassa käytettäviä tai muita teollisesti tärkeitä molekyylejä bioprosessilla

- käyttää tärkeimpiä analyysimenetelmiä, joita käytetään biomateriaalien karakterisoinnissa, geenitekniikassa, diagnostiikassa ja bioprosesseissa

Sisältö

- analyyttiset menetelmien ja valmistusmenetelmien laboratoriotyöt (biomateriaalit, kudosteknologia geenitekniikka, diagnostiikka ja bioprosessit)

Oppimateriaalit

Most of the material will be available on Its-learning environment. Some material student need to find itself according to instructions on Its

Opetusmenetelmät

Laboratory work in groups, team-based learning in groups

Tenttien ajankohdat ja uusintamahdollisuudet

No exam, assessment is based on study plans, overall performance in laboratory, laboratory notebook and writen report.

Toteutuksen valinnaiset suoritustavat

2-4 students may conduct the course by working in the the research group (Biomaterials and Diagnostics). This type of the implementation has to be agreed separate with the instructors (Mika Jokinen and Jani Pelkonen).

Sisällön jaksotus

Methods in Biotechnology will be implemented as a conventional lab implementation concsisting of three larger work topics:
1) Bioreactor cultivation of E. coli and production of mEGFP protein.
2) Downstream and purification (heat treatment + affinity chromatography) of mEGFP including gel and total protein analysis.
3) Production of alginate based ceramic hydrogel, 3D printed implant, crossling with different times and rheological analyses of material properties.

The reporting consists of one group report coverin all 3 topics. The deadline for the final report is XX th of January 2024.

Arviointiasteikko

H-5

Arviointimenetelmät ja arvioinnin perusteet

Written report 0 – 5 (group evaluation)
Overall performance in laboratory during the 3 working weeks and Laboratory notebook (incl. written study & analysis plans i.e. weekly schedules incl. daily tasks) can affact +/- 1 grade individually.

Hylätty (0)

Työsuunnitelmissa on selviä puutteita tai ne on tekemättä ja suunnitellussa aikataulussa ei pysytä.
Laboratoriotyöskentely ei onnistu ilman ohjausta.
Laboratoripäiväkirjasta puuttuvat oleelliset kirjaukset.
Laboratorioraporteissa on oleellisia puutteita tai ne on tekemättä.

Arviointikriteerit, tyydyttävä (1-2)

Työsuunnitelmissa on puutteita tai ja suunnitellussa aikataulussa on vaikea pysytä
Laboratoriotyöskentelyssä tairvitaan jatkuvaa ohjausta.
Laboratoripäiväkirjan kirjauksissa on puutteita.
Laboratorioraportieissa on puutteita.

Arviointikriteerit, hyvä (3-4)

Työsuunnitelmissa on vähäisiä puutteita ja suunnitellussa aikataulussa on ajoittaisia haasteita.
Laboratoriotyöskentelyssä tairvitaan vähäistä ohjausta.
Laboratoripäiväkirjan kirjauksissa on vähäisiä puutteita, mutta havaintoja ja johtopäätöksiä on esitetty.
Laboratorioraportit vastaavat tehtävienantoja, mutta niissä on vähäisiä puutteita.

Arviointikriteerit, kiitettävä (5)

Työsuunnitelmat ovat kattavia ja suunnitellussa aikataulussa pysytään.
Laboratoriotyöskentely on itsenäistä ja osaavaa.
Laboratoripäiväkirjan kirjaukset ovat kattavia ja havainnot sekä johtopäätökset ovat perusteltuja.
Laboratorioraportit vastaavat tehtävienantoja ja ne ovat selkeitä sekä kattavia. Raporteissa esitetyttyjen tulosten pohdinta ja johtopäätökset ovat perusteltuja.

Ilmoittautumisaika

01.06.2022 - 18.09.2022

Ajoitus

14.11.2022 - 16.12.2022

Opintopistemäärä

5 op

Toteutustapa

Lähiopetus

Yksikkö

Tekniikka ja liiketoiminta

Toimipiste

Kupittaan kampus

Opetuskielet
  • Suomi
  • Englanti
Koulutus
  • Prosessi- ja materiaalitekniikan koulutus
Opettaja
  • Jani Pelkonen
Ryhmät
  • PBIOKES19
    Bio- ja kemiantekniikan koulutus koulutus
  • PBIOKES19bio
    PBIOKES19bio

Tavoitteet

Opintojakson jälkeen opiskelija osaa
- valmistaa kudosteknologiassa käytettäviä biomateriaaleja

- valmistaa diagnostiikassa käytettäviä tai muita teollisesti tärkeitä molekyylejä bioprosessilla

- käyttää tärkeimpiä analyysimenetelmiä, joita käytetään biomateriaalien karakterisoinnissa, geenitekniikassa, diagnostiikassa ja bioprosesseissa

Sisältö

- analyyttiset menetelmien ja valmistusmenetelmien laboratoriotyöt (biomateriaalit, kudosteknologia geenitekniikka, diagnostiikka ja bioprosessit)

Oppimateriaalit

Most of the material will be available on Its-learning environment. Some material student need to find itself according to instructions on Its

Opetusmenetelmät

Laboratory work in groups, team-based learning in groups

Tenttien ajankohdat ja uusintamahdollisuudet

No exam, assessment is based on study plans, overall performance in laboratory, laboratory notebook and writen report.

Toteutuksen valinnaiset suoritustavat

2-4 students may conduct the course by working in the the research group (Biomaterials and Diagnostics). This type of the implementation has to be agreed separate with the instructors (Mika Jokinen and Jani Pelkonen).

Sisällön jaksotus

Methods in Biotechnology will be implemented as a conventional lab implementation concsisting of three larger work topics:
1) Bioreactor cultivation of E. coli and production of mEGFP protein.
2) Downstream and purification (heat treatment + affinity chromatography) of mEGFP including gel and total protein analysis.
3) Production of alginate based ceramic hydrogel, 3D printed implant, crossling with different times and rheological analyses of material properties.

The reporting consists of one group report coverin all 3 topics. The deadline for the final report is 15 th of January 2023.

Arviointiasteikko

H-5

Arviointimenetelmät ja arvioinnin perusteet

Written report 0 – 5 (group evaluation)
Overall performance in laboratory during the 3 working weeks and Laboratory notebook (incl. written study & analysis plans i.e. weekly schedules incl. daily tasks) can affact +/- 1 grade individually.

Hylätty (0)

Työsuunnitelmissa on selviä puutteita tai ne on tekemättä ja suunnitellussa aikataulussa ei pysytä.
Laboratoriotyöskentely ei onnistu ilman ohjausta.
Laboratoripäiväkirjasta puuttuvat oleelliset kirjaukset.
Laboratorioraporteissa on oleellisia puutteita tai ne on tekemättä.

Arviointikriteerit, tyydyttävä (1-2)

Työsuunnitelmissa on puutteita tai ja suunnitellussa aikataulussa on vaikea pysytä
Laboratoriotyöskentelyssä tairvitaan jatkuvaa ohjausta.
Laboratoripäiväkirjan kirjauksissa on puutteita.
Laboratorioraportieissa on puutteita.

Arviointikriteerit, hyvä (3-4)

Työsuunnitelmissa on vähäisiä puutteita ja suunnitellussa aikataulussa on ajoittaisia haasteita.
Laboratoriotyöskentelyssä tairvitaan vähäistä ohjausta.
Laboratoripäiväkirjan kirjauksissa on vähäisiä puutteita, mutta havaintoja ja johtopäätöksiä on esitetty.
Laboratorioraportit vastaavat tehtävienantoja, mutta niissä on vähäisiä puutteita.

Arviointikriteerit, kiitettävä (5)

Työsuunnitelmat ovat kattavia ja suunnitellussa aikataulussa pysytään.
Laboratoriotyöskentely on itsenäistä ja osaavaa.
Laboratoripäiväkirjan kirjaukset ovat kattavia ja havainnot sekä johtopäätökset ovat perusteltuja.
Laboratorioraportit vastaavat tehtävienantoja ja ne ovat selkeitä sekä kattavia. Raporteissa esitetyttyjen tulosten pohdinta ja johtopäätökset ovat perusteltuja.